去垢剂的选择
摘要
本文综述了实验室去垢剂及其在生物医学实验中的应用。本文综述了离子型、非离子型和两性离子型去垢剂及其一般性能,以及各组常用去垢剂的相关信息。最后,我们对一些常用去垢剂的实验室调查结果进行了简要讨论。
介绍
生物医学实验室使用的去垢剂是温和的表面活性剂(表面作用剂),用于细胞溶解(即细胞膜破裂)和释放细胞内材料。它们是两亲性分子,同时含有亲水和疏水区域。这种两亲性使得去垢剂能够破坏蛋白质、蛋白质脂质和脂质的结合、变性蛋白质和其他大分子,并防止免疫化学分析和蛋白质结晶中的非特异性结合。
实验室研究中使用的去垢剂有很多种。新的两亲性化合物,通常设计用于特定用途,继续开发(例如,麦芽糖新戊二醇[1]和糖基取代的二羧酸盐[2])。本文综述了最常用的实验室去垢剂的特点和应用。
Table 1. Classification of detergents.
Type | Chemicals |
ionic | sodium dodecyl sulfate (SDS), deoxycholate, cholate, sarkosyl |
non-ionic | Triton X-100, DDM, digitonin, tween 20, tween 80 |
zwitterionic | CHAPS |
chaotropic | urea |
去垢剂是两亲性有机化合物,由疏水性非极性碳氢化合物部分(尾部)和亲水性极性基团(图1a)组成。这种分子结构与构成细胞膜的两亲性磷脂非常相似,只是磷脂具有一对附着于亲水性基团的疏水尾(图1d)。当在适当浓度和温度下溶解于水中时,两亲性分子自组装成结构,使它们的亲水性头组保持在外部,疏水性尾部保持在内部远离水。由于它们的分子差异,去垢剂分子形成球形胶束(图1c),而磷脂更有可能形成双层(图1d)。分子结构的相似性使得去垢剂能够穿透磷脂双层膜,从而破坏细胞膜。
此外,胶束的疏水核心可以结合到蛋白质的疏水区域(图1b)。胶束中去垢剂分子的数量称为聚集数,这是一个用来评估膜蛋白溶解性的重要参数[3]。疏水区的长度与疏水性程度成正比,在去垢剂中是相当恒定的,而带电的头组是可变的。温度和浓度是去垢剂相分离和溶解度的重要参数。在给定温度下观察胶束的最小去垢剂浓度称为临界胶束浓度(CMC)。在低于CMC的任何浓度下,只观察到单体;在高于CMC的浓度下,胶束和单体与其他不溶于水的非胶束相共存。同样,形成胶束的最低温度称为临界胶束温度(CMT)。CMC也受人头组亲脂性程度的影响。一般来说,低亲脂性或脂恐怖性会导致高CMC。
普通去垢剂根据其特性分为三类:离子型(阴离子型或阳离子型)、非离子型和两性离子型。下面我将讨论这些类别中的常用去垢剂,并提供有关实验室去垢剂的选择和使用的重要信息。
一个好的去垢剂应该能够溶解细胞,溶解蛋白质,并适合你的下游应用。此外,还应考虑天然或变性形式的可溶性蛋白质。没有适用于所有应用的理想去垢剂,即使在同一应用中,结果也各不相同(表3)。因此,在考虑了各种选择后,往往需要反复试验才能找到最佳的去垢剂,而去垢剂的混合物可能是最佳的。此外,去垢剂工作液的新鲜制备通常是避免水解和氧化的最佳实践。
Table 3. Properties and main applications of common detergents
Detergent | MW (Da) monomer | MW (Da) micelle | CMC (mM) 25oC | Aggregation No. | Cloud Point (oC) | Avg. Micellar Weight | Strength | Dialyzable | Applications |
SDS | 289 | 18,000 | 7-10 | 62 | >100 | 18,000 | Harsh | Yes | Cell lysis, Electrophoresis, WB, hybridization |
Triton X-100 | 625 | 90,000 | 0.2-0.9 | 100-155 | 65 | 80,000 | Mild | No | Enzyme immunoassays, IP, Membrane solubilization |
CHAPS | 615 | 6,150 | 6 | 10 | >100 | 6,150 | Mild | Yes | IEF, IP |
NP-40 | 680 | 90,000 | 0.059 | 45-50 | Mild | No | IEF | ||
n-dodecyl-β-D-maltoside | 511 | 0.15 | 98 | 50,000 | Protein Crystallization | ||||
Tween-20 | 1228 | 0.06 | 76 | Mild | No | WB, ELISA, Enzyme immunoassays | |||
Digitonin | 1229 | 70,000 | <0.5 | 60 | 70,000 | Mild | No | Membrane solubilization |