技术概述
DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。脊椎动物DNA的甲基化状态与生长发育调控密切相关,比如在肿瘤发生时,抑癌基因CpG岛以外的CpG序列非甲基化程度增加,CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态,导致抑癌基因表达的下降。
技术详情
技术名称 | 技术原理 | 参考文献 |
Bisulfite sequencing,BSP | Bs结合测序 | Frommer et al. 1992 |
COBRA | Bs结合酶切 | Xiong et al. 1997 |
Methylation-specific PCR,MSP | Bs结合PCR | Herman et al. 1996 |
MethyLight | Bs结合定量PCR | Eads et al. 2000 |
HRM | Bs结合高分辨率溶解曲线 | Wittwer et al. 2003 |
Pyrosequencing | Bs结合焦磷酸测序 | Colella et al. 2003 |
MSRE-PCR | 酶切结合PCR | Singer-Sam et al. 1990 |
MS-SnuPE | Bs结合单核苷酸延伸 | Gonzalgo and Jones 1997 |
MS-SSCA | Bs单链构象分析 | Maekawa et al. 1992 |
MSO | Bs结合芯片分析 | Adorjan et al. 2002 |
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