RIP是研究体内蛋白与RNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联细胞内的“蛋白-RNA”互作复合物，裂解细胞后，用靶蛋白特异的抗体（或标签抗体）做免疫沉淀，获得“靶蛋白-RNA”互作复合物，去交联分离其中的RNA；针对预测的靶蛋白结合RNA的序列设计引物，做qPCR实验，验证预测的RNA是否与靶蛋白有结合；或者将分离出来的RNA做高通量测序，筛选到可能与靶蛋白结合的RNA。