分子量是蛋白质关键特征参数之一，也是有机化合物最基本的理化性质参数。分子量正确与否往往代表着所测定的有机化合物及生物大分子的结构正确与否。分子量同时也是多肽、蛋白质等鉴定中首要参数，随着基因组学和蛋白质组学研究的推进，样品蛋白质分子量测定的科学研究工作已经受到越来越广泛的关注。

质谱法分析（Mass Spectrometry, MS）蛋白的基本原理是通过电离源将蛋白质分子转化为离子， 然后利用质谱分析仪的电场、磁场将具有特定质量与电荷比值（M/Z）的蛋白质离子分离开来，经过离子检测器收集分离的离子，确定离子的M/Z值，分析鉴定未知蛋白。通常结合相应的处理及其他技术，能够比较准确、快速地鉴定蛋白质。