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微基生物科技(上海)
有限公司 

基生物科技(上海)有限公司,是专门从事微生态 / 微生物分子生态学相关问题研究的高科技服务公司。微基生物为客户提供整套的微生态研究方案:涵盖实验的前期规划,样本采集、保存方法,预实验与效果评估,实验及数据分析与解析。微基生物致力于协助科研人员探索微生态与健康、生产、环境之间隐藏的奥秘,更好地利用微生物资源。 

       微基生物是国内极少数同时开展Illumina MiSeq、Ion PGM、Roche 454高通量测序分析,PacBio第三代高通量测序分析,PCR-DGGE变性梯度凝胶分析,实时荧光定量PCR(Real-time qPCR),克隆文库等多种微生态分析方法的公司。公司拥有经验丰富的技术团队,涉及分子生物学、医学、生物信息学、统计生态学等方面,核心成员具有10余年一线科研工作经验。

        微基生物已完成600余项微生物多样性分析项目,分析样本15000余例。研究对象涉及粪菌、肠道、口腔、皮肤等人体微生物,土壤、水体(海洋、湖泊、冰川、鱼塘)、沉积物、空气等环境样品,植物根系、瘤胃、动物消化道等与农牧业相关的样本,以及其他特殊或极端环境的各类样本。合作单位包括中科院、清华大学、复旦大学、同济大学、香港大学、新华医院、中山医院、海洋研究所、中国极地研究中心等众多医学及科研单位。

        微基生物,专注微生态研究,紧跟国际分子生物学技术、生物信息学、统计分析技术的发展,以更好的服务质量,协助研究者解码微生物世界的奥秘! 

聚生物推荐技术

微生物多样性/宏基因组

服务内容:
1.放线菌多样性分析;
2. 微生物多样性及宏基因组分析;
3. 细菌或原核生物16S rRNA;
4.真核生物 18S rRNA;
5.古细菌多样性分析16S rRNA;
6. 真菌多样性分析ITS序列;
7. 特定功能微生物多样性分析。

微生物基因水平研究

服务内容:
1.菌种鉴定;
2. 宏转录组;
3. 宏基因组;
4.靶基因检测。

代谢组学

研究平台:
核磁共振技术 NMR(Nuclear Magnrtic Resonce)可对340余种水溶性代谢物小分子开展绝对定性定量检测分析。
气质联用技术 GC-MS(Gas Chromatography and Mass Spectrometry)可对37种常见脂肪酸的绝对定性定量检测非靶向广筛相对定性定量检测。
液质联用技术 LC-MS(Liquid Chromatography and Mass Spectrometry)可对植物激素的绝对定性定量检测,非靶向广筛相对定性定量检测。

生信分析

1.常规分析:微生物种属鉴定及相关分析、OTU群落聚类及相关分析、多样性指数统计、香农指数曲线、稀释性曲线、Rank Abundance 曲线、韦恩图(Venn);
2. 高级绘图:LDA EffectSize 组间群落差异分析、分级发育树、环形发育树、微生物间相互关系分析图、网络图、客户定制分析绘图;
3. 样本组间差异分析:heatmap(热图)、PCA主成分分析、PCoA 主坐标分析、(un)Weighted UniFrac 分析、metastats组间群落显著性差异分析、NMDS非度量多维尺度分析。
4.环境因子与微生物:RDA/CCA分析。

微生物分离培养

服务内容:
1. 菌群非靶向分离培养;
2.特定肠道菌群分离培养;
3.菌株厌氧培养。

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