研究某个基因的功能最常用的手段是在宿主细胞中过表达或者沉默该基因，筛选稳定细胞系。针对难转染的干细胞，可以建立标准的转基因技术服务体系，结合高效的慢病毒系统，可以准确地将目的基因和示踪基因转染到目的细胞中，得到稳定表达或沉默特定基因的细胞株。

慢病毒几乎可以感染所有种类的细胞，并且在感染后可以整合到受感染细胞的基因组，进行长时间的稳定表达。利用慢病毒的特性，将外源DNA克隆到具有某种抗性的慢病毒载体中并感染宿主细胞，利用载体中所含的抗性标志进行筛选，可得到稳定表达或沉默特定基因的细胞株。