技术概述
dsRNA(double-stranded RNA),双链RNA在细胞内诱导同源序列的基因表达受抑的现象称为RNA干扰。
dsRNA 可以通过注射、电穿孔和化学试剂介导的转染等方式介入动物和细胞内。dsRNA的制备是实施RNAi较为关键的一步。目前常用的dsRNA制备方法主要有2 种:体外转录法和体内载体表达法。其中体外转录法合成dsRNA可以在预期的PCR产物两端连上转录起始点(如T7、SP6等),先用RNA聚合酶转录合成单链RNA, 再互补成dsRNA。
相比而言,要制备大量的dsRNA,采用体内载体表达法即构建质粒,在细菌体内表达更为经济高效。带有发夹环的dsRNA包括2个反向互补的靶序列片段,中间插入一个单链环。通常构建这样的DNA模板,需要3步连接(3步克隆法)实现,这种方法操作较为繁琐。
长链dsRNA设计合成流程:
1. 通过数据库同源比对方法选取合适的目的基因序列
2. 目的基因序列的克隆
3. 向目的基因上加入接头,可使用的接头有T7,T3,SP6。
4. 体外反转录及双链RNA退火。
5. 测定浓度。
技术详情
参考文献
[1]梁艳, Saksamerprome V , Sritunyalucksan K , et al. 一种大规模制备双链RNA的简单方法及其在斑节对虾中的应用[J]. 水产学报, 2010, 34(7):1011-1017.
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