电子显微镜，简称电镜（Electron Microscope，简称EM），是使用电子来展示物件的内部或表面的显微镜。电镜与光镜相比电镜用电子束代替了可见光，用电磁透镜代替了光学透镜，并使用荧光屏将肉眼不可见电子束成像。

电子显微镜常用的有透射电镜（transmissionelectronmicroscope，TEM）和扫描电子显微镜（scanningelectronmicroscope,SEM）。