CRISPR Cas9为新型的基因组编辑技术，拥有操作简单，效率高，以及作用靶点多等优势，逐渐成为基因敲除，基因组突变和基因敲除等实验的标准操作工具。Cas9系统能在293T, K562, iPS等多种细胞中，进行有效的靶向酶切，进而引导非同源重组（NHEJ）或同源重组 （HR），效率在3-25%之间。

Cas9载体将编码Cas9蛋白的序列及其附属元件共同制造成为一个单一的载体。同时为了能够让这些组分进入真核细胞的细胞核，还加入了入核信号元件。这样一来，只要只需针对需要编辑的DNA序列合成一段DNA序列，插入这个载体的特定部位。在转入宿主细胞后，产生的人工构建的gRNA就能指导Cas9蛋白切割宿主细胞特定的DNA序列，从而起到基因编辑的作用。