RNA/DNA pull down是研究体外条件下RNA或DNA与蛋白互作的重要技术。该技术通过体外转录目的RNA的一部分或全长，用生物素标记转录产物，再与链霉亲和素磁珠孵育使之固定在磁珠上，用以“pull down”互作蛋白，纯化的产物蛋白经特定抗体的western-blot实验，可验证某种蛋白与目的RNA/DNA是否有相互作用；纯化的蛋白经质谱鉴定，即可筛选到与目的RNA结合的蛋白。

图1 RNA-Protein Pull-Down Protocol（图片来源：Thermo Fisher Scientific）