Southern 印迹杂交（Southern blot）是进行DNA 特定序列定位的通用方法。1975 年由英国人Southern 创建，是研究DNA 图谱的基本技术。其基本原理是：具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下，可按碱基互补的原则形成双链，此杂交过程是高度特异的。结合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果，便可绘制出DNA 分子的限制图谱。Southern 印迹杂交一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA 片段，将胶上的DNA 变性并在原位将单链DNA 片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上，经干烤或者紫外线照射固定，再与相对应结构的标记探针进行杂交，用放射自显影或酶反应显色，从而检测特定DNA分子的含量。