亚利桑那COVID-19基因组学联盟成立致力研究病毒如何进化
来源：News Medical | 作者：James Ives, M.Psych.| 编译：聚生物 | 时间：2020-4-10
今天宣布，希望之城的附属机构——翻译基因组研究所(TGen)，北亚利桑那大学的病原体和微生物研究所，以及亚利桑那大学的生态和进化生物学系组成了一个联盟，致力于追踪covid19冠状病毒。
利用最先进的技术和“大数据”分析的力量，新成立的亚利桑那COVID-19基因组学联盟(ACGU)的研究人员希望更好地了解这种病毒可能会如何演变，如何传播，以及它如何在普通人群中传播。这种分子流行病学方法将传统流行病学方法与基于病毒基因组高分辨率分析的进化建模相结合。
ACGU将对来自COVID-19患者的样本进行排序，分析病毒的遗传密码，追踪不同的毒株，显示每个样本的来源和可能的传播途径，并可能揭示一些细节，为诊断、抗病毒药物靶标和疫苗开发提供重要信息。
David Engelthaler博士是TGen的病原体和微生物组部门的联席主任和副教授，该部门是弗拉格斯塔夫的传染病部门，被称为TGen North：“只有通过基因组测序和先进的分析，我们才能开始在分子水平上全面了解这种疾病，寻找解开其奥秘的钥匙。”我们有能力对每个病人的每个菌株的基因组进行测序——这就是我们正在努力的方向。”
恩格尔塞勒博士是亚利桑那州前州流行病学家和州生物防御协调员。他曾在美国疾病控制与预防中心工作，从1993- 1994年亚利桑那州爆发汉坦病毒疫情开始，领导了超过25年的地方、国家和国际疾病暴发调查。他将协调新的ACGU对SARS-CoV-2病毒的基因组测序，这种病毒导致了COVID-19疾病。
该联盟的其他联合创始人是亚利桑那州两名领先的传染病科学家:保罗·凯姆(Paul Keim)博士和迈克尔·沃罗贝(Michael Worobey)博士。
凯姆博士是研究鼠疫和炭疽等病原体的世界专家。他与联邦调查局合作，在9/11事件后破获了“炭疽信件”一案。他是澳大利亚国立大学的生物学教授、微生物学讲座教授、病原体和微生物研究所(PMI)执行主任。他是TGen的杰出教授，TGen North的联席董事，将担任ACGU的董事。
基因组序列是分布式科学研究的理想对象，亚利桑那联盟将严重依赖国家和全球的研究来追踪这种疾病。然而，重要的是，地区专家参与这一过程，以最大限度地造福亚利桑那州公民，”凯姆博士说。
沃罗贝博士是亚利桑那大学生态学和进化生物学系主任，因其在病毒大流行方面的工作而闻名世界。利用基因组流行病学，他明确地追踪了艾滋病毒的起源和全球传播，并确定了为什么1918年的“西班牙流感”大流行导致数百万年轻人死亡。
“对病毒的分子分析为大流行如何开始以及如何抗击提供了重要线索，”Worobey博士说。“我们将利用亚利桑那州丰富的人才和基础设施进行这项努力。”
亚利桑那COVID-19基因组学联盟与全球其他组织类似，致力于在这种新型冠状病毒上站稳脚跟。快速共享数据和分析对于科学、医学和公共卫生了解大流行至关重要。具有讽刺意味的是，covid19在美国的第一个中心——西雅图，同时也是NextStrain的所在地。NextStrain是一个通过互联网追踪病原体基因组的网站。
由亚利桑那州科学家组成的联盟希望他们的区域测序将使亚利桑那州的医疗服务提供者和公共政策制定者在应对这一流行病方面具有优势。
与NextStrain一样，ACGU将公开其研究结果;供世界各地的流行病学家和病毒学家使用。
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