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大肠杆菌是第一个用于重组蛋白生产的宿主菌，它不仅具有遗传背景清晰，培养操作简单，转化和转导效率高，生长繁殖快，成本低廉，可快速大规模生产目的蛋白的优点，而且其表达外源基因产物的水平远远高于其他基因表达系统，表达的目的蛋白量甚至能超过细菌中蛋白量的30%，因此大肠杆菌是目前应用最广泛的蛋白质表达系统。