蛋白表达系统是指由宿主、外源基因、载体和辅助成分组成的体系。通过这个体系可以实现外源基因在宿主中表达的目的。一般由以下几个部分组成：

1、宿主。表达蛋白的生物体。可以为细菌、酵母、植物细胞、动物细胞等。由于各种生物的特性不同，适合表达蛋白的种类也不相同。

2、载体。载体的种类与宿主相匹配。根据宿主不同，分为原核（细菌）表达载体、酵母表达载体、植物表达载体、哺乳动物表达载体、昆虫表达载体等。载体中含有外源基因片段。通过载体介导，外源基因可以在宿主中表达。

3、辅助成分。有的表达系统中还包括了协助载体进入宿主的辅助成分。比如昆虫-杆状病毒表达体系中的杆状病毒。

除了大肠杆菌，枯草芽孢杆菌，毕赤酵母，酿酒酵母，昆虫细胞，哺乳动物细胞，植物细胞等表达系统外，新型表达系统仍在不断开发中。如结核分支杆菌表达系统、光合细菌Rb.sphaeroides表达系统、病毒样颗粒VLP表达系统等等。