现阶段测定蛋白质三维结构的方法主要有 X 射线晶体衍射分析，电镜三维重构技术以及核磁共振技术。
核磁共振（Nuclear magnetic resonance）是指原子核在外加恒定磁场作用下产生能级分裂，从而对特定频率的电磁波发生共振吸收的现象。

核磁共振主要步骤如下：
1. 先准备样品，浓缩蛋白质的水溶液（0.21－1mM），如果测1H谱需用D代试剂；
2. 将样品置于外加磁场中，测量共振频率，计算机通过频率得出每一对原子；
3. 核的偶合常数和NOE值，计算对应的原子间距离；
4. 最后构建模型。