微生物，即个体难以用肉眼观察的一切微小生物之统称。微生物包括：细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体，它个体微小，与人类关系密切。涵盖了有益跟有害的众多种类，广泛涉及食品、医药、工农业、环保、体育等诸多领域。在中国大陆地区及台湾的教科书中，均将微生物划分为以下8大类：细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。

微生物检测是运用微生物学的理论与方法，检验环境或样品中微生物的种类、数量、性质及其对人的健康的影响，以判环境或样品是否符合质量标准的检测方法。