微生物群落广泛分布在地球上的每个生态系统中，它们的活动影响着自然环境的营养循环、土壤肥力，有机质的分解，以及物质与能量之间的交换。现代分子生物学揭示，自然界中微生物群落及其栖息的环境远比人们预期的复杂和多样，通过纯培养技术在实验室所获取的微生物仅占环境微生物总量的1%左右。

宏蛋白质组是从蛋白质水平对给定位点的环境微生物群落的所有蛋白质组成进行大规模分析，可更好的推动对微生物群落的多样性、结构及潜在基因功能等方面的深入研究。

技术原理：收集样本后，提取样品中的总蛋白，蛋白经胰蛋白酶酶解成肽段后，与分级技术联用对复杂肽段样品进行分级处理，分级后的组分利用高灵敏度、高分辨率的串联质谱进行鉴定，随后进行数据库搜索获得蛋白鉴定结果。

应用领域：污水生物处理、海洋能量代谢和物质代谢、土壤群落分析、肠道菌群、发酵食品微生物群落分析。