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模式种（Type species、model organism）是生物分类学上的一个名词，是用来代表一个属或属以下分类群的物种，被首次发现，且被描述并发表的物种定为模式种。在科学研究中，模式生物是指受到广泛研究，对其生物现象深入了解的物种。根据从这些物种所得的科学研究结果，可以归纳出一些涵盖许多生物的的模型，并应用在各个领域的研究中。