reverse-ChIP
2019年6月28日
一条评论
反向染色质免疫共沉淀技术（reverse-Chromatin immunoprecipitation assay，reverse-ChIP）相对于染色质免疫共沉淀技术（ChIP），是一种在体内状态下分析DNA-蛋白质相互作用的新方法。
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反向染色质免疫共沉淀技术（reverse-Chromatin immunoprecipitation assay，reverse-ChIP）相对于染色质免疫共沉淀技术（ChIP），是一种在体内状态下分析DNA-蛋白质相互作用的新方法。
亚细胞定位是指某种蛋白或表达产物在细胞内的具体存在部位。例如在核内、胞质内或者细胞膜上存在。GFP是绿色荧光蛋白，在扫描共聚焦显微镜的激光照射下会发出绿色荧光，从而可以精确地定位蛋白质的位置。
基因分型（Genotyping）是利用生物学检测方法测定个体基因型（Genotype）的技术。 基因组中的遗传变异以许多不同形式存在，既有大规模结构性的染色体改变，也有单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP），
分子标记（Molecular Markers）的概念有广义和狭义之分。广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。狭义分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。
双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation，BiFC)分析技术，是由Hu等在2002年最先报道的一种直观、快速地判断目标蛋白在活细胞中的定位和相互作用的新技术。
启动子载体，据启动子序列特性，从基因组中调取启动子序列，将其构建至报告基因载体中，通过检测报告基因来分析启动子关键区域；同时可以通过构建一系列截短体启动子和定点突变可以确定关键的转录因子结合位点。
CRISPR Cas9为新型的基因组编辑技术，拥有操作简单，效率高，以及作用靶点多等优势，逐渐成为基因敲除，基因组突变和基因敲除等实验的标准操作工具。Cas9系统能在293T, K562, iPS等多种细胞中，进行有效的靶向酶切，
RNA 干扰（RNA interference, RNAi）技术，是将与内源mRNA 编码区同源的小片段（19~23 bp）外源双链 RNA（siRNA）导入细胞中，引发细胞中相应mRNA 高效特异性降解，从而导致特定基因表达沉默（knock down）的一种实验技术。
表达载体（Expression vectors）就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件（如启动子、RBS、终止子等），使目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。
原核表达系统是将外源cDNA片段克隆到原核表达载体上然后转化表达菌株，在原核生物来表达外源蛋白的系统，主要包括大肠杆菌表达、枯草芽孢杆菌表达、链霉素表达等。
差减文库 ( Subtractive cDNA library) 也称扣除文库、差减cDNA文库、抑制性消减文库（Suppression Subtractive hybridization, SSH）。减法杂交的本质是除去那些普遍共同存在的cDNA序列，从而使欲分离的目的基因的序列得到有效的富集，提高了分离的敏感性。
cDNA 文库(cDNA library ): 是指某种生物基因组转录的全部mRNA经反转录产生的cDNA片段分别与克隆载体（常用噬菌体或质粒载体）重组，并将其引入到相应的宿主细胞中（一般为E.coli.）繁殖和扩增，则每个细菌含有一段cDNA，
gDNA文库即基因组DNA（genomic DNA）文库，又称基因组文库（Genomic Library），把某种生物基因组的全部遗传信息通过克隆载体贮存在一个受体菌克隆子群体中，这个群体即为这种生物的基因组文库。
全基因合成 (Gene synthesis)，也称基因合成，即基因人工合成,是重要的基因获取手段之一，是指利用生物化学的方法将人工合成的寡核苷酸拼接成基因的一种技术。
TA克隆(TA cloing)是一种将PCR产物直接连接到T克隆载体的方法。TA克隆技术是利用了Taq聚合酶具有末端转移酶（TdT）活性，但却不具有3’-5’端外切酶校准活性的特点，可在PCR产物的3’末端加上一个非模板依赖的dA。
染色体步移(Chromosome walking)，又称为基因组步移（Genome walking），是指由生物基因组或基因组文库中的已知序列出发，逐步探知其旁邻的未知序列或与已知序列呈线性关系的目标序列的方法。
核酸是指DNA和RNA，高质量的核酸是所有分子生物学实验的基础。核酸提取服务可以快速地从动植物组织、细菌、真菌、细胞中提出高质量的DNA或RNA，以用于PCR、分子标记、基因杂交等各种科学研究。
特定代谢物含量检测属于靶向代谢组学分析。代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物（MW<1500）。其样品主要是血浆或者血清、尿液、唾液、以及细胞和组织的提取液，以及细胞和组织的提取液。
信号通路（Pathway）是多个蛋白质间相互作用，共同调节细胞功能和代谢活动的过程。而信号通路分析是通过对差异基因按照Pathway的主要公共数据库KEGG和Biocarta来进行分类，对Pathway中的基因进行基于离散分布的显著性分析，得到与实验目的有显著联系的Pathway 分类,该分类即导致样本性状差异的重要Pathway。
实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR)/QRT-PCR，是指在PCR反应体系中加入荧光基团，在 PCR 反应过程中，随着循环次数的增加，PCR产物的积累导致荧光信号的增强。因此，利用荧光信号积累来实时监测整个PCR进程，最后通过扩增曲线对未知模板进行定量分析的方法。