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微生物培养，是指借助人工配制的培养基和人为创造的培养条件（如培养温度等），使某些（种）微生物快速生长繁殖，称为微生物培养。微生物培养可分为纯培养和混合培养，前者是指对已纯化的单一菌种进行培养和利用；
微生物种类繁多，总数庞大，针对不同的微生物对能量、营养和理化条件的需求不同（包括各因子的种类和浓度不同），对现有培养基经过适当的优化改造可以用于新的微生物的分离培养。
微生物往往被视为“无处不在，无所不为”的生物，制作重组基因的载体和表达重组基因的受体也需要微生物。20世纪90年代后期开始了微生物基因组的研究。这项研究是从对微生物完整的全基因核苷酸测序入手，在分析基因结构的基础上，认识微生物的完整生物学功能。
生物多样性测序，又称扩增子测序，是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的某一或某几个区